从莫斯科撤军后, 艾德蒙一世的威望虽然受损，但他的嫡系军队仍得以保存，这令他在返回君士坦丁堡后能迅速镇压反对派, 维护了他身为奥古斯都的权威。但他并非不需要为他的失败付出代价。
“圣经派”是西蒙一世在位末期流行的一种教派，其创始人是一位名叫莱昂提乌斯的教士，他激烈地反对塞萨尔一世的宗教改革策略，认为世俗权力对宗教事务的干涉会带来灾难, 但他认同塞萨尔一世要求的建立廉洁教会的理念，西蒙一世在位时期，圣经派的势力得到了进一步发展, 他们深入民众, 宣传他们受到的苦难是因为君主的过失, 奥古斯都们煊赫的权柄令上帝不快, 才对他的民众降下责罚。
这样的言论收获了一定的市场，而在阿兰一世在位早期, 摄政的约翰·达拉瑟洛斯并没有及时意识到这些教士对皇权的威胁, 他奉行文化开放策略, 允许圣经派教士自由传教。在此期间, 圣经派开始向上层贵族渗透, 同时为了团结同样在政治上被边缘化的旧贵族, 他们又进一步阐明了对政权体制的构想，认为高贵的姓氏意味着学识、风度与教养, “将军的儿子比铁匠的儿子更懂得如何成为将军”。在约翰·达拉瑟洛斯辞职后，阿兰一世曾经召见圣经派的领袖聆听教义, 他对此的评价是“他们明明是一群野心家, 却想把自己塑造成圣人”, 他将圣经派视为教会的野心复辟, 对此予以严酷镇压。
他的行为取得了一定成效，但给他创造了更多敌人，他的儿子阿莱克修斯和女婿君士坦丁·杜卡斯是圣经派的同情者，认同应当让出权力以换取上帝的怜悯，狄奥多拉公主则对此嗤之以鼻，“清醒一些，这跟上帝毫无关系，他们反对父亲只是因为对现有的生活不满，我们该做的是给他们面包。”
她的策略被艾德蒙一世继承，但并不完全，在他在位初期，圣经派确实受到了遏制，但当人们意识到奥古斯都的战功并不能给他们带来更加富足的生活后，他们又重新选择了圣经派，并且逐渐狂热，演变到了反叛的地步，在教士的宣传下，艾德蒙一世失败的远征盖因他祖先们的渎神行为和他私生子的原罪，若不为此忏悔，上帝会降下更多的苦难以惩戒他的罪恶。
这些不利的谣言被野心家利用，他们试图借此推翻艾德蒙一世，拥戴被囚禁在修道院中的海伦娜公主登基，艾德蒙一世和安东尼娅皇后以老辣的手段将其击破，但艾德蒙一世仍需要对他未来的统治做出部署：经历了莫斯科的失败，他在未来五年内都无力再组织对神圣罗马帝国的征服，事实上，在决意撤军的那一刻起他就放弃了这一野心，转而决定将自己的野心拘束于东欧已经征服的土地，恢复凋敝的经济和崩溃的财政，但若圣经派执意破坏他的统治，他的余生都将疲于奔命，是以在权衡利弊后，艾德蒙一世决定与圣经派妥协，他召开了第三次尼西亚公会议，并邀请圣经派的代表出席。